Население Карачаевского городского округа и Карачаевского муниципального района необеспечено доброкачественной питьевой водой, все еще высок удельный вес проб водопроводной воды, не соответствующей гигиеническим требованиям. В октябре 2011 года лабораториями ФБУЗ Центр гигиены и эпидемиологии в КЧР по текущему контролю было исследовано на бактериологические показатели 55 проб воды водопроводной, из них 19 проб по г. Карачаевску, 36 проб не соответствуют гигиеническим требованиям (65%), из них 6 проб по г. Карачаевску (31,5%). Кроме этого, 50 проб воды водопроводной исследовано на санитарно-химические показатели, из них 15 проб по г. Карачаевску, 2 пробы воды не соответствуют гигиеническим требованиям (4%), все пробы по г. Карачаевску соответствуют требованиям. В октябре 2011 года зарегистрировано случаев заболеваний у жителей Карачаевского городского округа и Карачаевского муниципального района, в сравнении с аналогичным периодом 2010 года: Наименование заболеваний Карачаевский городской округ Карачаевский муниципальный район октябрь 2011 года октябрь  2010 года октябрь 2011 года октябрь 2010 года Острые кишечные инфекции (ОКИ) с неустановленным возбудителем 22 15 14 17 Трихофития 0 0 1 0 Микроспория 1 2 0 2 Укусы 2 0 37 0 ОРВИ 50 15 10 5 Пневмонии 0 0 1 0 Заместитель начальника ОСН Управления Роспотребнадзора по КЧР Хапаев Б. А.